怀孕40天可以进行药流,药流建议在停经小于等于49天之内,孕囊直径小于2-3cm者。药流第一天给予米非司酮,第三天给予米索前列醇。米非司酮是孕激素拮抗剂,可以使胚胎松动,米索前列醇是缩宫剂,可以诱发宫缩,将松动的胚胎排出体外,药流成功率在90%以上,只有接近10%的失败率,表现为胚胎没有排出体外,或者阴道大出血,或者宫腔较多组织残留,需要再次手术清宫。