对于这场亚急性发病，患者出现了明显的发热症状。口腔内，纤维状疱疹如小米粒般大小，伴随着显著的痛感。手掌心和脚板也出现了类似的疱疹，屁股和膝关节偶尔也会受到影响。这些疱疹周围呈现淡红色，内部的液体较少。部分患儿还出现了咳嗽、流鼻涕、食欲不振、恶心、呕吐、头痛等症状。
手足口病是一种由多种肠道病毒引发的传染性疾病，主要影响五岁以下的婴幼儿。典型的症状包括口腔内部如内颊部、舌、软腭、硬腭、嘴唇内侧等位置，以及手脚心、肘、膝、屁股和前阴等区域，出现灰白小疱疹或红色丘疹，这些疱疹的大小如同米粒或黑豆，周围泛红。
这些临床医学特征不会带来痒感、痛感、结疤或结痂。这些红疹子与蚊子叮咬、药物疹、嘴唇牙床疱疹或麻疹都有所不同。口腔内的疱疹一旦破溃，就会形成溃烂，导致患者常常流口水，影响进食。患者的尿液颜色偏黄。重症患者可能伴随发热、流鼻涕、咳嗽等症状。
手足口病通常在一周内可以恢复，但如果疱疹破溃，很容易引发感染。由于手足口病的流行性强度大、感染力强、传播途径复杂，病毒可以通过唾沫飞沫传染或含有病毒的蚊虫叮咬过的食物，通过鼻腔、口腔传染给健康儿童，也可以通过直接接触感染。
手足口病的主要表现在皮肤和口腔上，但病毒也会侵害心、脑、肾等重要器官。在疾病流行时，需要加强对患者的临床监测。如果出现高烧、白细胞计数不明原因升高而找不到其他感染灶的情况，需要警惕爆发性心脏病的可能。最近的研究发现，EV71病毒比CoxAl6病毒更容易引发手足口病，并可能导致无菌性心肌炎。其症状包括高烧、头痛、颈部疼痛、恶心、易烦躁、睡眠不稳定等。人体有时还会出现非特异性红斑丘疹，甚至斑点状血点。合并中枢神经系统的症状在两岁以内的患儿中较为常见。
