剧中朱祁镇一直是单恋，允贤一直都爱着朱祁钰，虽然后来喜欢过朱祁镇。成了朱祁钰的第二任皇后。土木堡之变后，允贤随英宗流落异族部落，部落首领也先被她所吸引，但两人之间巨大的差异让允贤拒绝了部落首领的爱。英宗为了保护允贤不惜舍弃皇帝的尊严，一直为她挡风遮雨。三年后，英宗寻机会带着允贤逃回大明，却发现自己挚爱的弟弟已被拥立为王。祁钰尝到大权在握的滋味不肯让位，也为了心爱的女子在哥哥身边多年怀恨在心，兄弟反目成仇。英宗被圈禁，允贤被关在宫中，两个有情人相爱却不能在一起。至此在经历了这么多人生的坎坷波折之后，允贤终于意识到一直默默守候在身边的英宗才是她的真爱。朱祁钰得重病，朱祁镇最终还是当了皇帝。
应该喜欢朱祁镇了，41集允贤要死了还在想着朱祁钰，46集对他失望了
41集
允贤被大风雪冻得意识模糊了，眼前开始浮现与祁钰相识相知的一幕幕。
46集
汪国公曾派人刺杀太上皇，祁钰却将此事嫁祸孙太后；孙太后的“病”也与祁钰汪美麟等人脱不了干系。得知祁钰如此卑劣行径，允贤终于对祁钰失望透顶，但亦无可奈何，只能尽力医治太后。
《女医明妃传》大结局允贤和朱祁镇在一起，朱祁钰病逝了。《女医·明妃传》是根据历史人物事件改编的古装传奇励志剧。该剧讲述了明代著名女医谭允贤凭借对医学的痴迷和热爱，克服重重困难，开创并建立女医制度，最终成为一代女国医的经历。
《女医明妃传》大结局: 朱祁钰病逝, 若干年后，钱皇后去世，英宗传位于太子朱见深，独自出宫寻找允贤。夕阳斜照，英宗走过小桥，一眼就望见了那间挂着“谭氏医馆”门匾的民房，缓缓地推开门走进去，只见一人着红色衣衫，轻挽袖口，正蹲在院子里洗手，手腕间的红玉镯子在夕照里透着光。女子似乎对门口所站之人有所察觉，缓缓地转过头，眉目动人，还似当年模样。在允贤及医女们的共同努力下，也在英宗的盛德感召下，明朝不仅官方建立了女医制度，世人亦渐渐地接受了女子行医，女子患病不用再受限于男女大防，隐疾得治，性命也大为增长。
