为明确诊断及鉴别诊断，可选择的检查有：精液分析或细菌培养、前列腺特异性抗原、尿细胞学、经腹或经直肠B超（包括残余尿测定）、尿流率、尿动力学、CT、MRI、尿道膀胱镜检查和前列腺穿刺活检等。具体诊断方法如下：
1、病史采集
询问患者的病史，帮助确诊疾病。
2、体格检查
直肠指检可了解前列腺大小、质地、有无结节、有无压痛及其范围与程度，盆底肌肉的紧张度、盆壁有无压痛，按摩前列腺获得前列腺液。
3、四杯试验
本试验在前列腺炎的诊断中具有重要临床意义。具体方法：收集尿液以前嘱病人多饮水，包皮过长者应将包皮上翻。清洗阴茎头、尿道口后，病人排尿并收集尿液10ml，继续排尿约200ml后收集中段尿10ml，然后停止排尿，做前列腺按摩并收集前列腺液，最后再次收集尿液10ml。将各标本分别做镜检和培养，通过以上标本细菌菌落数量的比较，可鉴别是否有前列腺炎或尿道炎。
4、实验室检查
（1）前列腺按摩液（EPS）常规检查：正常的EPS中白细胞<10个/HP，卵磷脂小体均匀分布于整个视野，pH 6.3～6.5，红细胞和上皮细胞不存在或偶见。当白细胞>10个/HP，卵磷脂小体数量减少，有诊断意义。
（2）尿常规分析及尿沉渣检查：尿常规分析及尿沉渣检查是排除尿路感染、诊断前列腺炎的辅助方法。
（3）细菌学检查：慢性前列腺炎推荐“两杯法”或“四杯法”病原体定位试验。
（4）其他病原体检查：包括沙眼衣原体和支原体检查。
5、器械检查
（1）B超：尽管前列腺炎患者B超检查可以发现前列腺回声不均，前列腺结石或钙化，前列腺周围静脉丛扩张等表现，但目前仍然缺乏B超诊断前列腺炎的特异性表现，也无法利用B超对前列腺炎进行分型。
（2）尿动力学：首先，尿流率，尿流率检查可以大致了解患者排尿状况，有助于前列腺炎与排尿障碍相关疾病进行鉴别。其次，尿动力学检查，可以发现膀胱尿道功能障碍。
（3）CT和MRI对鉴别精囊、射精管等盆腔器官病变有潜在应用价值，但对于前列腺炎本身的诊断价值仍不清楚。
6、鉴别诊断
慢性前列腺炎缺乏客观的、特异性的诊断依据，临床诊断时应与可能导致骨盆区域疼痛和排尿异常的疾病进行鉴别诊断，以排尿异常为主的患者应明确有无膀胱出口梗阻和膀胱功能异常。需要鉴别的疾病包括：良性前列腺增生、睾丸附睾和精索疾病、膀胱过度活动症、神经源性膀胱、间质性膀胱炎、腺性膀胱炎、性传播疾病、膀胱肿瘤、前列腺癌、肛门直肠疾病、腰椎疾病、中枢和外周神经病变等。
