影响阴茎正常的发育：包皮不能翻起来，阴茎头不能外露，事阴茎不能正常生长，时间就了能造成小阴茎。
影响龟头的正常发育：在一些儿童包茎的患者，如果出现反复的尿道口感染，就容易造成包皮和龟头粘膜的粘连，影响龟头的正常发育，严重的会出现龟头畸型。
使阴茎发炎：包皮内有丰富的皮脂腺，能分泌大量的皮脂。包茎时，使包皮内皮脂腺的分泌物不能排出，皮脂和尿中的沉淀物合成乳酪状奇臭的“包皮垢”。包皮垢适宜细菌生长，故可引起阴茎头及包皮发炎。病菌通过尿道还可以造成尿路感染。发生在尿道口的炎症，愈合后可引起尿道口狭小，造成排尿困难。
发炎之后，粘膜上皮细胞脱落，作为中心核，外围因垢而形成包皮结石。父母发现孩子包皮腔有小硬块大多感到十分焦虑，其实，只要稍经扩开包茎环处理，即可取出结石。
有了包茎，阴茎与龟头发育常受限制，由于发育受约束，从外表看似小阴茎。临床调查表明，20岁以前施行包皮环切术者的阴茎癌发病率与包皮正常者并无明显差异，因此选择手术的时间应在20岁之前，可以明显的减少小儿先天性包茎的危害。
