试管婴儿和自然怀孕最主要的不同是试管婴儿的受精，还有胚胎早期发育是在体外完成，而不是在体内完成，具体如下：
1、自然怀孕：需要女性卵巢排出卵子之后，跟精子在输卵管内相遇并授精，形成受精卵，然后种植到母亲的子宫内，在子宫内发育成胚胎，继续发育。
2、试管婴儿：需要女性通过超促排卵，多个卵泡发育之后经阴道穿刺取卵，将卵子取出之后，跟男方的精子在体外实验室完成受精的过程，并完成早期胚胎的发育过程。当胚胎发育成第三天的胚胎，或者是第五天、第六天囊胚时，就可以种植到妈妈的子宫内。
所以试管婴儿和自然怀孕最主要不同就是体外受精，还有胚胎早期发育是在体外进行。
