对于双侧输尿管畸形的患者，如果没有出现尿路感染、梗阻或点滴性尿失禁等症状，并且没有严重的并发症如输尿管积水、反流和结石等，治疗方法可以暂缓。这类病人在临床中大约占到了半数。对于需要治疗的情况，手术原则主要包括以下几点。
对于不完全双重输尿管，如果上肾功能正常且伴有输尿管-输尿管反流，手术方法包括双重输尿管的纵向吻合，以及肾段输尿管膀胱的再植。特别是在双重输尿管汇合点位于上1/3处的情况下，这两种手术方式是主要的选择。
在完全双重输尿管的情况下，如果上肾功能存在但伴有膀胱-输尿管反流，除了进行输尿管膀胱再植，还需要加入抗反流手术，以更好地保护患者的泌尿系统功能。
在某些情况下，如尿路感染无法控制，或存在点滴尿失禁并伴有开口异位症，或上肾段功能基本丧失时，可能需要进行肾部分切除术。在手术中，输尿管可以在汇合点附近或最低水平进行切断。对于不完全双重输尿管的患者，可以在汇合点附近切断；而对于完全双重输尿管的患者，可以在最低水平进行切断。这样的操作旨在恢复患者的泌尿系统正常功能，提高生活质量。
对于双侧输尿管畸形的患者，治疗方案的制定需要根据患者的具体情况而定，旨在保护患者的肾功能和泌尿系统功能。
